Also falls noch jemand damit Probleme haben sollte:
Den alten niCe-Team Battlecentre Preset löschen und durch den neuen ersetzen. Dazu einfach den Battlecentre Server aus dem rechten Fenster (Serverbrowser) auswählen und mit Rechtsklick als neuen Preset einrichten.
Wenn jemand noch einen individuellen Pfad für die Servermods eingerichtet hatte, muss dieser natürlich noch vor dem Updaten bzw. Synchronisieren angebenen werden.
Danke für die Hilfe im TS diesbezüglich!!